FreeSurfer

FreeSurfer

FreeSurfer est un logiciel d’imagerie des IRM de cerveau développé par Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging2 du Massachusetts General Hospital avec le support du CorTechs Labs, Inc, La Jolla, CA3. C’est un outil important d’imagerie neurofonctionnelle, et facilite la visualisation des régions d’activations fonctionnelles du cortex cérébral, jusque-là rendue difficile par le nombre important de plis de celui-ci. FreeSurfer permet à la fois des analyses surfaciques et volumiques, qui utilisent prioritairement la surface de la matière blanche4. Sont également inclus des outils pour une reconstruction topologiquement correct et géométriquement précise de la surface piale et de l’interface matière grise/blanche. Mesurer l’épaisseur cortical, les propriétés des surfaces et des plis corticaux et effectuer des registrations (trouver la transformation linéaire ou non-linéaire entre le cerveau d’un sujet particulier et un cerveau qui sert d’atlas) basées sur un modèle cortical sont des autres fonctionnalités de FreeSurfer. De plus, le logiciel est capable de séparer automatiquement 35 régions non corticales.